MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015850	TTCC	2	8	1981158	1981165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_015850	GGT	2	6	1981200	1981205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015850	ATT	2	6	1981392	1981397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015850	GGA	2	6	1981454	1981459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_015850	CTC	2	6	1983268	1983273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_015850	GAT	2	6	1983361	1983366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_015850	ACA	2	6	1984677	1984682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_015850	GGC	2	6	1985576	1985581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_015850	CCA	2	6	1985677	1985682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_015850	GGC	2	6	1985687	1985692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_015850	GC	3	6	1987423	1987428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4512	NC_015850	GCT	3	9	1988786	1988794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_015850	CAG	2	6	1989535	1989540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_015850	GC	3	6	1989578	1989583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_015850	CCG	2	6	1989610	1989615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_015850	CACC	2	8	1989703	1989710	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4517	NC_015850	CGC	2	6	1989712	1989717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_015850	CAG	2	6	1989727	1989732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_015850	ACG	2	6	1989766	1989771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_015850	TCT	2	6	1989797	1989802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_015850	GCACA	2	10	1991201	1991210	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4522	NC_015850	A	6	6	1992806	1992811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015850	TACC	2	8	1992887	1992894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_015850	ATT	2	6	1993801	1993806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015850	TTA	2	6	1993812	1993817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015850	CCA	2	6	1993921	1993926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_015850	TGT	2	6	1993995	1994000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4530	NC_015850	GCA	2	6	1994083	1994088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_015850	CG	3	6	1994104	1994109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_015850	CCG	2	6	1994131	1994136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_015850	GGCA	2	8	1994142	1994149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_015850	CTT	2	6	1994164	1994169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_015850	CGG	2	6	1994855	1994860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4538	NC_015850	ACC	2	6	1994929	1994934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_015850	TCT	2	6	1994942	1994947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_015850	C	6	6	1994985	1994990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4541	NC_015850	CTT	2	6	1995006	1995011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_015850	CGC	2	6	1995012	1995017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_015850	GC	3	6	1995024	1995029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_015850	ATC	2	6	1995031	1995036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_015850	GCC	2	6	1995104	1995109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_015850	AAC	2	6	1995117	1995122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_015850	GAC	2	6	1995282	1995287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_015850	T	7	7	1995342	1995348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015850	GTT	2	6	1995356	1995361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015850	TGC	2	6	1995567	1995572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_015850	GCTA	2	8	1995605	1995612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_015850	GGAT	2	8	1995755	1995762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_015850	GGTT	2	8	1995824	1995831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015850	GATG	2	8	1995982	1995989	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015850	GAT	3	9	1995994	1996002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4557	NC_015850	TCCT	2	8	1996037	1996044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_015850	GAT	2	6	1996048	1996053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015850	CAA	2	6	1996195	1996200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_015850	GTC	2	6	1996210	1996215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_015850	GCA	2	6	1996224	1996229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_015850	C	6	6	1996368	1996373	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4563	NC_015850	GC	3	6	1996376	1996381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_015850	GTC	2	6	1996457	1996462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_015850	CGA	2	6	1996497	1996502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_015850	CAT	2	6	1996650	1996655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4569	NC_015850	TG	3	6	1997288	1997293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015850	T	6	6	1997335	1997340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015850	G	7	7	1997409	1997415	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4586	NC_015850	CG	3	6	2013623	2013628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4607	NC_015850	T	7	7	2023559	2023565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4612	NC_015850	CGC	3	9	2023711	2023719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_015850	CTT	2	6	2023765	2023770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_015850	GAGG	2	8	2023775	2023782	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4620	NC_015850	A	6	6	2026369	2026374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_015850	GCTT	2	8	2026388	2026395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4622	NC_015850	GA	3	6	2026427	2026432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_015850	TAC	2	6	2026531	2026536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4625	NC_015850	ATA	2	6	2028590	2028595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015850	AGA	2	6	2028643	2028648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_015850	GCG	2	6	2028664	2028669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_015850	CCA	2	6	2028730	2028735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_015850	TTC	2	6	2028765	2028770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_015850	AT	3	6	2028802	2028807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4894	NC_015850	TCG	2	6	2103366	2103371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4896	NC_015850	TCC	2	6	2103447	2103452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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